Review : Kimia Komputasi

CALCULATION OF DESCRIPTOR WITH ANION SALTS:
QUANTITATIVE STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP ANALYSIS OF ANTIMALARIAL 1,10-PHENANTHROLINE DERIVATIVES COMPOUNDS




REVIEW JURNAL
(tugas Kimia Komputasi)



Disusunoleh:
Ahmad Said 10612036
Ahmad Safarudin 106120






PRODI ILMU KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PEENGETAHUN ALAM
UNIVERSITAS ISLAM INDONESIA
2013
TujuanPenelitian
Berusahamenemukanantimalariabaruuntukmelawanparasit yang resistentersebutdenganmelibatkan anion garamturunan 1,10-fenantrolin dalamperhitungandeskriptordengancaramengikatkansecarakovalendengankationgaramnya.

LangkahKerja
1. Menghitungdeskriptordenganmetode semi empirik PM3
Setiapsenyawa yang digunakansebagaibahanpenelitiandibuatstrukturtigadimensidenganpaket program HyperChem. Selanjutnyadilakukanoptimasistrukturgeometriuntukmemperolehkonformasistruktur yang lebihstabilmenggunakanmetode semi empirik PM3. OptimasistrukturdilakukanmenggunakanmetodeoptimasialgoritmaPolak-Ribiereataumetodegradiensekawan, dengannilai RMS =0,001 kkal/(Å.mol). Setelahdiperolehstruktur palingstabildilakukanperhitungan single point untukpencatatan data perhitungan yang dilihatdalam filerekaman (file log). Parameter yang digunakanadalahparameter elektronikberupamuatanbersih atom, momendipole, energi LUMO, energi HOMO, polarisabilitasdanlog P. Struktursenyawagaramturunan 1,10-fenantrolinsebagaibahanpenelitiandihitungdengan 2 carayaitudenganmelibatkankanter ion garamdantidakmelibatkankanter ion garam.

2.Analisispersamaan HKSA menggunakanmetoderegresi linear
Variabeltakbebasdalampenelitianiniadalahaktivitasantimalaria (IC50)hasileksperimen,sedangkanvariabelbebas yang digunakanadalahberupa:muatanbersih atom, momen dipole, energi LUMO,energi HOMO, polarisabilitasdan log P. Semuavariable dianalisismenggunakanregresimultilinearmetodebackward untukmengetahuiurutanvariabelbebasmanayang berpengaruhterhadapaktivitassenyawa. Hasil yang diperolehberupapersamaan HKSA besertanilaiparameter statistiksepertinilai r, r2dan F. Selainparameter statistiktersebut, darihasilperhitunganjugadiperolehnilaitetapandannilaikoefisiensetiapvariable bebas yang terlibatdalampersamaanyang dihasilkan.Nilaikoefisien yang diperolehdigunakanuntukmenghitungaktivitasantimalariateoritis. Selanjutnyadilakukanperhitungannilai PRESS untukmengetahuikualitasdankemampuanprediksidaripersamaan yang
dihasilkan.
PRESS =∑_i^n▒(log⁡〖IC50 ekperimen 〗–log⁡〖IC50 prediksi〗 )^2

Deskriptor yang digunakan
Padapenelitianini, descriptor-deskripto yang digunakanadalahsebagaiberikut:
Muatanbersih atom
Momendipole
Energi LUMO
Energi HOMO
Polarisabilitas
log P

PersamaanAktivitas HasilPerhitungan

Persamaanaktivitasantimalaria dari senyawaturunan 1,10-fenantrolin yang telahdidesainadalahsebagaiberikut :
ln 1/IC50= 15,29 – (12,399)qC2 + (106,149)qC5 + (71,572)qC6 + (82,445)qC7 – (4,801)qC8+ (73,828)qN10 – (34,446)qC12 – (6,020)E.LUMO– (0,033)polarisabilitas – (0,283)logP

denganharga:
n=16; r = 0,998; r2= 0,996; Fhit/Ftab= 44,69; SE=0,146;danPRESS = 0,095.